精神中心综合办公室为精卫中心下设职能部门，主要承担精神卫生中心统筹管理、教学管理、科研管理、学会管理及中心宣传等工作；负责统筹中心新技术新项目、设备、人员等管理；科研项目的申报、审核、登记汇总、各科室开展科研督导；教学计划、年度教学排课、教师授课督导、教学工作落实等；精卫中心总体宣传、微信公众号运营、科普推介；承担挂靠在中心的各学会学术交流会议、年会的组织、学会年度审核、学术交流推进等各项工作及日常行政管理工作；拥有工作人员11人，其中高级职称人员6人。

协助精神卫生中心医教研协同发展。